Le musée a été fondé en 1893 par Herbert Balch, un homme de manière motivée par la curiosité sur notre monde qui, il est devenu un pionnier caver, ainsi que d'un naturaliste, géologue et archéologue. Il explora les grottes de la Mendip collines et les sites de fouilles préhistoriques tels que Wookey Hole, amassant une collection de minéraux, de fossiles et d'objets. Le musée abrite également quelques-unes des statues de la célèbre West Front of Wells Cathedral, et une collection de samplers géorgien.