Het museum heeft ongebruikelijk, obscure en zeldzame instrumenten, zoals een Spaanse bugle, een contrabas slang, een Snorrebot, Pocket violen, slangenbezweerders, Didjeridu en Hurdy-gurdies. De John Donaldson Collectie van Musical Instruments geeft Wind, String en percussie-instrumenten in drukke Victoriaanse gevallen en bevat een interactieve Sound Laboratorium Reid naast het Concertgebouw. De Raymond Russell Collection van Early Keyboard Instruments bevat rijkversierde exposities dateert van 1586 tot 1840 en is gelegen in de buurt van het oudste auditorium in Schotland, St Cecilia's Hall in Niddry Street, Cowgate.